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基础医学学科坚持开放式的学科发展模式,立足医学国际前沿,瞄准国家重大需求,凝炼研究方向。2010年取得基础医学一级学科硕士学位授权点,2019年5月,取得了基础医学一级学科博士学位授权点。面向转化医学的发展趋势,基础医学系设置了分子与细胞生物学、免疫学、传染病学和神经科学四个重点发展方向,并力求学科布局合理,重点突出,师资素质好,研究起点高。经过十年的发展,目前已经具备了精良的科研设施、高水平的技术平台、跨学科交流的创新团队和高水平的教学团队;学科定位明确,致力于揭示重大疾病发生的分子机制及建立疾病治疗的新策略,已在免疫疾病的发生与治疗、肿瘤发生的遗传基础与生物治疗、爆发性传染性病毒学研究、生殖与发育及代谢与衰老研究等方面已达到国际先进水平。


       
生物医学工程学科具有明显的理工专业特征,以医、工结合为思路,设置了生物医学影像、神经工程、微纳医学和医疗仪器四个重点方向,已被评定为国家一级重点学科。此外,清华-约翰霍普金斯大学生物医学工程联合研究中心、清华大学-哥伦比亚大学高等基因组技术联合研究中心及清华大学生物医学影像研究中心的成立为生物医学工程的学科发展提供了良好平台。


       2010
年7月清华大学成立公共健康研究中心,并挂靠在医学院; 2011年10月, 公共健康学科面向全国招收公共卫生专业硕士学位(MPH)研究生,并将国际先进的公共健康理念贯穿于研究生教学中,实现了真正意义上的多学科融合;2013年,为响应国家“一带一路”的号召,公共健康研究中心受教育部委托培养国际公共卫生硕士研究生(IMPH),截止2018年9月,已经连续五年招收了来自30个亚非拉国家的95名学生。目前公共卫生学位项目已经包含公共卫生、高级健康管理与转化医学和医学遗传咨询三个方向。中心致力于培养引领全球公共健康发展的卓越领导者,努力改善发展中国家的健康状况和健康公平性,为构建人类命运共同体做出应有的贡献。